Wanneer om homologie te gebruik?

INHOUDSOPGAWE:

Wanneer om homologie te gebruik?
Wanneer om homologie te gebruik?
Anonim

Homologie-modelle kan ook gebruik word om subtiele verskille tussen verwante proteïene te identifiseer wat nie almal struktureel opgelos is nie . Die metode is byvoorbeeld gebruik om katioonbindingsplekke op die Na+/K+ ATPase te identifiseer en om hipoteses oor verskillende ATPases se bindingsaffiniteit voor te stel.

Waarvoor word homologiemodelle gebruik?

Homologie-modellering is een van die berekeningsstruktuurvoorspellingsmetodes wat gebruik word om proteïen 3D-struktuur te bepaal vanaf sy aminosuurvolgorde. Dit word beskou as die akkuraatste van die berekeningsstruktuurvoorspellingsmetodes. Dit bestaan uit veelvuldige stappe wat eenvoudig en maklik is om toe te pas.

Wat is homologiemodellering en hoekom is dit nodig?

Homologiemodellering verkry die driedimensionele struktuur van 'n teikenproteïen gebaseer op die ooreenkoms tussen sjabloon- en teikenreekse en hierdie tegniek blyk doeltreffend te wees wanneer dit kom by die bestudering van membraanproteïene wat is moeilik om te kristalliseer soos GPCR, aangesien dit 'n hoër mate van begrip van … bied

Hoe maak jy 'n homologiemodel?

daar is verskeie stappe betrokke by die homologiemodellering

  1. sjabloonkeuse deur jou teikenvolgorde te gebruik. Vir hierdie doel kan jy BLASTp-soektog doen teen alle beskikbare proteïenstrukture (PDB's). …
  2. Belyning van sjabloon en teikenvolgorde. …
  3. Kwaliteit van jou model. …
  4. Verfyningvan jou model dienooreenkomstig.

Wat maak 'n goeie homologie-modellering?

As ons 'n "hoogs suksesvolle homologiemodel" definieer as een met <=2 Å rmsd vanaf die empiriese struktuur, dan moet die sjabloon >=60% volgorde-identiteit hê met die teiken vir 'n sukses koers >70%. Selfs by hoëvolgorde-identiteite (60%-95%), het soveel as een uit tien homologiemodelle 'n rmsd >5 Å vs.

Aanbeveel:

Interessante artikels
Waarom is tuinmaak goed vir die siel?
Lees meer

Waarom is tuinmaak goed vir die siel?

Tuinmaak is terapeuties op soveel vlakke. Om net in die natuur te wees, kan jou bui verbeter en jou meer rustig laat voel. Die daad van grawe, plant en water kan help om jou gedagtes van die stres van die daaglikse lewe af te neem. … Tuinmaak is goed vir die gees, liggaam en siel.

Wat gebeur ná wyckoff?
Lees meer

Wat gebeur ná wyckoff?

Markdown-fase Die Markdown is die laaste fase van die Wyckoff-pryssiklus. Die Markdown-proses kom soos 'n afwaartse neiging begin na die verspreidingsfase. … Die Markdown word bevestig wanneer die prysaksie die onderste vlak van die plat reeks van die horisontale verspreidingskanaal op die grafiek breek.

Wat was die kathuis voorheen?
Lees meer

Wat was die kathuis voorheen?

Unionstraat 15, Glasgow. Die Kathuis gedurende die vroeë aande is 'n wonderlike plek vir onder 18's. Dit is eens The Viva disco genoem. … Die Kathuis op Union St is ook vanaf ongeveer 1990-1994 Deja vu, Heaven and Industria genoem. Dit het nie verbasend gisteraand gebeur as Deja vu-.