Arabinose is 'n vyfkoolstofsuiker wat wyd in die natuur voorkom en kan dien as 'n enigste koolstofbron in baie bakterieë. Die proteïenprodukte van drie gene (araB, araA en araD) word benodig vir arabinose-afbraak in lede van die Enterobacteriaceae-familie, soos E. coli en S.
Wat doen arabinose aan bakterieë?
Dus wanneer arabinose teenwoordig is om die arabinose-operon aan te skakel, word GFP geproduseer en die bakterieë kan fluoresceer. Sonder arabinose word die GFP-geen nie uitgedruk nie en is daar geen fluoressensie nie. Deur dus voedingstofsamestelling te wissel, kan 'n navorser beheer wanneer (en of) bloeiwyse in die getransformeerde bakterieë voorkom.
Wat is die rol van arabinose in bakteriële transformasie?
Arabinose tree op as 'n allosteriese reguleerder van AraC, wat verander aan watter DNA-werwe dit bind en hoe dit 'n dimeer vorm. Onthou dat arabinose die suiker is wat deur die proteïene van die AraBAD-operon gekataboliseer word. Wanneer arabinose gevoeg word by die omgewing waarin E. coli leef, bind dit styf aan AraC.
Waarom word arabinose gebruik?
Gebruik in biologie
In sintetiese biologie word arabinose dikwels gebruik as 'n eenrigting- of omkeerbare skakelaar vir proteïenuitdrukking onder die Pbadpromotor in E. coli. Hierdie aanskakeling kan ontken word deur die teenwoordigheid van glukose of omgekeer word deur die byvoeging van glukose in die kultuurmedium wat 'n vorm van katabolietonderdrukking is.
Hoebeïnvloed arabinose geenregulering en uitdrukking in bakterieë?
Wanneer arabinose teenwoordig is, verslap araC die DNS-konfigurasie sodat transkripsie kan plaasvind, maar wanneer hierdie koolhidraat afwesig is, beperk dieselfde proteïen die DNS om sy vermoë om te bind, te verminder met RNA-polimerase.